革蘭氏陽性菌的細胞壁由于含有較多的肽聚糖層，這種層可以使得細胞壁具有一定的負電性，而紅霉素則是一種帶正電的大分子物質，在細胞壁上會與帶負電的肽聚糖層相互作用，并形成一個復合物，從而對細菌進行殺菌作用。紅霉素還可以抑制細菌的蛋白質合成，使得細菌無法繼續生長繁殖，進一步增強其殺菌效果。